南方农业学报

作者：陈惠龙, 林长宏, 张博, 闫路路, 邱丽华, 赵超,

关键词：花鲈, 基因芯片, 单核苷酸多态性（SNP）, 亲权鉴定, 群体遗传结构, 系谱信息,

【目的】 从鉴别准确率和成功率等方面评价采用基因芯片进行花鲈亲权鉴定的可行性，构建精准的分子溯源体系，为花鲈种质资源保护、近交防控及其分子育种体系构建提供理论依据。【方法】 采集同池混养的5个家系（F1、F5、F6、F7和F8）83尾花鲈个体，通过自主研发的花鲈40K SNP液相芯片进行亲权鉴定和群体遗传分析，系统评估不同花鲈家系的遗传特征及基因芯片技术在亲权鉴定中的适用性。【结果】 5个花鲈家系的观测杂合度（Ho）介于0.2423~0.3725，平均为0.3273；期望杂合度（He） 介于0.2476~0.3238，平均为0.2913；多态信息含量（PIC）介于0.2045~0.2575，平均为0.2349，除了F7家系外，其余家系均为低度多态性。F6家系与F1家系和F7家系间为高度遗传分化遗传分化系数（Fst） >0.15，F7家系与F8家系间为低度遗传分化（Fst<0.05），其余家系间则为中度遗传分化（0.05<Fst<0.15）。基于原始系谱数据的群体遗传结构分析发现，5个花鲈家系可划分为6个类群，以F6家系较混杂，其群体内的遗传多样性较丰富。在双亲已知条件下，5个花鲈家系的双亲累积鉴定率为88.00%，实际双亲鉴定率为65.33%，单亲累积鉴定率为88.00%，实际单亲鉴定率为66.67%，孟德尔错误率为0.44%~0.73%（<0.90%）。基于系谱梳理后的群体遗传分析结果显示，5个花鲈家系最终聚类为6个遗传类群，与基于原始系谱数据的群体遗传分析结果相互印证。亲缘关系分析结果表明，同一家系内个体间的亲缘关系较紧密，而不同家系个体间的亲缘关系相对较疏远。【结论】 基于40K SNP液相芯片的亲权鉴定与群体遗传分析结果显示，同池混养5个花鲈家系群体遗传多样性呈中低度多态性特征，家系间遗传分化明显，亲缘关系较疏远，最终划分为6个遗传类群。说明利用基因芯片技术评估不同花鲈家系间的群体遗传结构特征和亲缘关系是一种可行的方法，能准确揭示家系间的遗传关系及系谱结构，为花鲈种质资源管理和家系纯度控制提供技术支撑。

来源：2026年第3期

《南方农业学报》期刊编辑部

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