国内刊号:45-1381/S
国际刊号:2095-1191
发布日期:
作者:王超洪, 彭丽华, 欧阳乐军, 李莉梅, 柯梓婷, 沈超,
关键词:尾巨桉, CesA基因家族, 全基因组鉴定, 组织表达分析,
【目的】 对尾巨桉CesA基因家族进行全基因组鉴定并分析其组织表达模式,挖掘在茎中高度表达的候选基因,为解析该家族的功能和调控机制及尾巨桉纤维品质改良提供理论依据。【方法】 基于尾巨桉全基因组数据,鉴定尾巨桉CesA基因家族成员并进行基因结构、染色体定位和共线性分析,预测其编码蛋白理化性质、亚细胞定位、保守基序、保守结构域、二级结构和三级结构并进行系统发育分析。利用实时荧光定量PCR检测尾巨桉CesA基因家族成员在速生期尾巨桉芽、叶、茎、根中的相对表达量。【结果】 共鉴定出15个尾巨桉CesA基因家族成员,按照其在染色体上的位置分别命名为EuCesA1~EuCesA15。15个EuCesAs蛋白的分子量为8027.03~123688.28 Da,理论等电点为4.67~9.95,多为不稳定的亲水蛋白。15个EuCesAs蛋白多定位于叶绿体,二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。15个EuCesAs基因不均匀分布于8条染色体上,4对基因(EuCesA2与EuCesA3、EuCesA4与EuCesA9、EuCesA5与EuCesA10、EuCesA8与EuCesA13)存在共线性关系。根据系统发育分析可将15个EuCesAs蛋白分为a组和b组,二者的保守基序数量和位置差异较大且所含保守结构域不同。实时荧光定量PCR检测结果表明,大部分EuCesAs基因表达具有组织特异性,其中 EuCesA2、EuCesA3、EuCesA7基因在茎中的相对表达量均显著高于芽(P<0.05),且EuCesA2基因在茎和根中高度表达。【结论】 鉴定出15个尾巨桉CesA基因家族成员,其中EuCesA2基因在茎中高度表达,推测其参与尾巨桉初生壁纤维素合成和韧皮纤维细胞壁加厚过程,从而影响木材纤维素含量和生物质转化效率。
来源:2026年第3期
《南方农业学报》期刊编辑部