南方农业学报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:45-1381/S

国际刊号:2095-1191

南方农业学报杂志2026年第2期:猪SLC39A基因家族鉴定及SNP位点与繁殖性状的关联分析

发布日期:

作者:韦一, 程锋, 兰干球, 梁晶,

关键词:大白猪, SLC39A基因家族, 锌稳态, 关联分析,

【目的】开展猪SLC39A基因家族鉴定及SNP位点与繁殖性状的关联分析,为猪高繁殖力的遗传改良提供候选分子标记。【方法】使用生物信息学方法鉴定大白猪SLC39A基因家族成员并分析其理化性质。筛选SLC39A基因家族单核苷酸多态性(SNP)位点,并采用一般线性模型进行各SNP位点不同基因型与健仔数的关联分析。合成含有C和G等位基因的靶序列,构建至pGL3-basic双荧光素酶报告载体并转染至人胚胎肾细胞中,转染48 h后测定萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶活性。【结果】SLC39A基因家族蛋白相对分子质量介于9.37~94.20,理论等电点(pI)介于5.03~8.46,属于不稳定蛋白。SLC39A基因家族成员在染色体上均有多个编码蛋白的基因编码区,基因结构较复杂,共鉴定出7个保守基序(Motif),长度介于21~44个氨基酸,Motif-2、Motif-3和Motif-7的保守程度较高,Motif-2为所有SLC39A基因家族蛋白共有的保守基序。SLC39A基因家族成员不均匀地分布在10条染色体上。在大白猪基因组内共检测到1次片段复制事件,SLC39A5与SLC39A10基因存在片段重复。系统发育树显示,猪与人、大鼠、牛、羊和猴的SLC39A1~SLC39A14蛋白亲缘关系较近,猴与人的SLC39A1~SLC39A14蛋白亲缘关系较近。大白猪SLC39A基因家族蛋白中SLC39A1、SLC39A2、SLC39A9和SLC39A11蛋白位于网络的核心位置,与其他蛋白表现出较强的互作关系。大白猪SLC39A基因家族共鉴定到13个符合哈迪—温伯格平衡的SNP位点,3个SNP位点与健仔数显著关联(P<0.05,下同)。SLC39A8基因rs344840408C>G的CC基因型个体的健仔数显著高于GG基因型个体。【结论】猪SLC39A基因家族在进化上较为保守,蛋白成员间存在紧密的互作网络,共同维持锌稳态。SLC39A基因家族部分成员的变异(SLC39A1基因rs319315931A>G、SLC39A8基因rs344840408C>G、SLC39A11基因rs338265001T>C)可能通过影响基因表达或锌转运功能而改变母猪健仔数。

来源:2026年第2期

《南方农业学报》期刊编辑部

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