国内刊号:45-1381/S
国际刊号:2095-1191
发布日期:
作者:谢明宏, 韩飞, 贺锡山, 牟琪, 曾广湖, 贾雨轩, 龚婷,
关键词:味觉受体, <i>TAS1R3</i>基因, SNP位点, 生长性状, 关联分析,
【目的】筛选贵州地方猪味觉受体TAS1R3基因单核苷酸多态性(SNP)位点,解析群体遗传特征和TAS1R3基因与体尺性状的关联,为贵州地方猪种质资源的遗传改良提供候选分子标记。【方法】以242头贵州地方猪(从江香猪、黔东花猪、江口萝卜猪、关岭猪和白洗猪)为研究对象,针对TAS1R3基因的全部外显子设计9对特异性引物进行PCR扩增与测序。筛选TAS1R3基因SNP位点,并进行SNP位点的遗传学分析、连锁不平衡分析、单倍型和双倍型分析、关联分析及TAS1R3基因mRNA二级结构预测。【结果】在从江香猪、黔东花猪、江口萝卜猪和关岭猪4个贵州地方猪中共鉴定出4个错义突变SNP位点:g.63613635T>C、g.63614535G>A、g.63616733T>C和g.63617113G>A。遗传学分析结果显示,黔东花猪和关岭猪中g.63613635T>C和g.63616733T>C处于中度多态水平。卡方χ2检验结果显示,4个SNP位点的基因型分布均未显著偏离哈迪—温伯格平衡(P>0.05)。连锁不平衡分析结果显示,江口萝卜猪g.63613635T>C和g.63614535G>A、g.63614535G>A和g.63616733T>C、g.63613635T>C和g.63616733T>C及关岭猪g.63613635T>C和g.63616733T>C、g.63613635T>C和g.63617113G>A、g.63616733T>C和g.63617113G>A间存在强连锁不平衡效应。关联分析结果显示,从江香猪g.63613635T>C TC基因型个体的体长和胸围均显著高于TT基因型个体(P<0.05,下同),g.63616733T>C TC基因型个体的胸围指数、体长和胸围均显著高于TT基因型个体。【结论】4个贵州地方猪TAS1R3基因中鉴定出4个错义突变SNP位点,g.63613635T>C和g.63616733T>C在黔东花猪和关岭猪中处于中度多态水平。在江口萝卜猪和关岭猪中存在强连锁不平衡效应。从江香猪TAS1R3基因SNP位点H1H3双倍型个体与更优的体尺性状相关。TAS1R3基因具有影响贵州地方猪生长性状的遗传潜能。g.63613635T>C和g.63616733T>C及其双倍型H1H3可作为后续分子标记辅助选择的参考。
来源:2025年第11期
《南方农业学报》期刊编辑部