南方农业学报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:45-1381/S

国际刊号:2095-1191

南方农业学报杂志2025年第11期:肉苁蓉内生细菌分离及合成菌群构建

发布日期:

作者:操时婷, 涂思送, 彭瑜, 石勇, 吴志华, 邢睿,

关键词:肉苁蓉, 高通量分离培养, 内生细菌, 合成菌群,

【目的】研究肉苁蓉内生细菌并构建合成菌群,为筛选促进肉苁蓉种子萌发的功能菌群、提升肉苁蓉人工种植效率提供参考依据。【方法】采用高通量分离培养技术,从肉苁蓉茎中分离、培养、纯化细菌菌株,采用最大似然法构建菌种系统发育树,同时对菌种的促生功能固氮、溶磷、产铁载体和产吲哚乙酸(IAA)的能力进行测定。基于基因组规模代谢模型计算菌种间的竞争性指数、互补性指数及代谢物转移潜力,筛选并构建合成菌群,采用两两组合的细菌菌株平板对峙试验验证合成菌群的有效性。【结果】高通量测序获得280个细菌子序列变体(ASV),隶属于4门7纲13目20科31属,优势菌门为变形菌门(75.7%),优势菌纲为γ-变形菌纲(69.4%),优势菌目为假单胞菌目(32.1%),优势菌科为假单胞菌科(31.0%),除未被分类的属外,优势菌属为假单胞菌属(31.0%)。进一步从细菌ASV中分离培养共得到122株内生细菌,隶属于4门4纲8目10科13属24种,优势菌门为变形菌门(60.6%),优势菌属为假单胞菌属(33.6%),优势菌种为龙舌兰芽孢杆菌(22.9%)。分别在10% TSB培养基和R2A培养基中分离出23种(89株)和6种(33株)内生细菌,在上述2种培养基上均能分离获得的菌株有5种,分别为乳酸假单胞菌、斑点沙雷氏菌、亲根假单胞菌、金色短杆菌和羊皮纸假单胞菌。分离的共计24种细菌均具有不同程度的产IAA能力,分别有70.8%、58.3%、62.5%的菌种有固氮、溶磷和产铁载体的能力。对24种菌的竞争性指数和互补性指数进行分析,结果显示,泡囊短波单胞菌与其他菌种的竞争作用最弱;斑点沙雷氏菌与其他菌种的竞争作用最强。24种菌以4种为1组进行组合,共构建合成菌群组合方式10626种,筛选出较优的10种组合;泡囊短波单胞菌和耐盐不动杆菌2种细菌呈现低竞争、高互补的状态,表现为其中一种菌分泌的部分代谢物能被另一种菌利用。在平板对峙试验中发现,大部分菌落间的间隔距离随培养时间延长呈均匀缩小趋势,且未形成抑菌圈,表明菌株间无强拮抗作用。【结论】基于高通量分离培养技术分离纯化培养获得122株24种具有产IAA能力的内生细菌,最终筛选出10组具有显著代谢互补特性的合成菌群可用于下一步田间验证。

来源:2025年第11期

《南方农业学报》期刊编辑部

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