南方农业学报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:45-1381/S

国际刊号:2095-1191

南方农业学报杂志2025年第10期:鳜NF-κB1基因在抗嗜水气单胞菌中的表达分析及SNP开发

发布日期:

作者:蔡康宁, 高锦华, 郭宁馨, 赵金良, 赵岩,

关键词:鳜, <i>NF-κB1</i>基因, 嗜水气单胞菌, siRNA干扰, 单核苷酸多态性位点,

【目的】 探究鳜核因子κB亚基1(NF-κB1)基因在抗嗜水气单胞菌免疫应答中的功能,挖掘相关单核苷酸多态性(SNP)位点,为揭示鳜抗细菌感染的分子机制和抗病育种提供理论依据。【方法】 利用生物信息学分析鳜NF-κB1基因序列特征。利用实时荧光定量PCR检测NF-κB1基因在各组织中及嗜水气单胞菌感染后各组织中的相对表达量。通过siRNA干扰检测NF-κB1基因对促炎基因IL-1β和TNF-α的调控作用。结合Sanger测序与关联分析,筛选NF-κB1基因中与抗病性状显著关联的SNP位点。【结果】 鳜NF-κB1基因编码区全长2553 bp,编码850个氨基酸残基。NF-κB1蛋白包含RHD-n、IPT、ANKYR和Death等4个结构域,RHD-n和IPT结构域在进化中较为保守。鳜NF-κB1蛋白与鞍带石斑鱼等鱼类聚为一支,氨基酸序列相似性较高。NF-κB1基因在鳜肌肉组织中的相对表达量显著高于头肾和脾脏等组织(PNF-κB1基因在肝脏、头肾和肌肉组织中的相对表达量整体上均有所升高。siRNA干扰NF-κB1基因后,肌肉组织中IL-1β和TNF-α基因相对表达量显著降低。NF-κB1基因内含子区SNP3(g.1025140 C&gt;A)位点与鳜抗嗜水气单胞菌能力显著关联。【结论】 鳜NF-κB1基因通过其高度保守的RHD-n结构域在抗细菌感染的核心免疫通路中扮演关键角色。NF-κB1基因通过经典信号通路,在感染后正向调控IL-1β和TNF-α等关键促炎基因的表达,驱动鳜早期炎症防御反应。同时,NF-κB1基因内含子区SNP3(g.1025140 C&gt;A)位点与抗病性显著关联,该区域可能存在重要调控元件。

来源:2025年第10期

《南方农业学报》期刊编辑部

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