南方农业学报

作者：王海荣, 吴建龙, 郝金旺, 陈文潇, 洪永健, 张笑瑜, 徐志玮, 郗宇腾, 侯丛哲, 胡晶红,

关键词：中华大蟾蜍, TRAF, 免疫应答, 基因家族, 表达模式,

【目的】 开展中华大蟾蜍肿瘤坏死因子受体相关因子（Tumor necrosis factor receptor-associated factor，TRAF）基因家族成员鉴定及其表达模式分析研究，为深入解析中华大蟾蜍免疫调控机制提供理论依据。【方法】 基于中华大蟾蜍基因组数据，鉴定TRAF基因家族成员并预测编码蛋白理化性质，使用生物信息学方法分析TRAF基因家族成员编码蛋白结构、保守基序、保守结构域、基因结构、染色体定位情况，进行共线性分析并构建系统发育树。采用实时荧光定量PCR检测取酥前后TRAF基因家族成员相对表达量，通过相关分析探究TRAF基因家族成员间的相关性。【结果】 中华大蟾蜍TRAF基因家族拥有BgaTRAF1、BgaTRAF2、BgaTRAF3、BgaTRAF4、BgaTRAF5、BgaTRAF6和BgaTRAF7等7个成员，均为亲水性蛋白，且均含有α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲结构。除BgaTRAF7蛋白外，其余6个蛋白的保守基序数量和位置大体一致，且多数蛋白含有RING、MATH和zf-TRAF结构域。TRAF基因家族7个成员归属于7个亚家族，含有外显子7~16个，内含子6~15个，BgaTRAF4基因还含有1个超长内含子。仅存在1对片段复制基因BgaTRAF2和BgaTRAF3，与小鼠间存在5对TRAF共线性基因，与斑马鱼间存在2对TRAF共线性基因。TRAF1与TRAF2亚家族亲缘关系较近，TRAF7亚家族独立成支，与其他亚家族亲缘关系较远。未取酥耳后腺中BgaTRAF2和BgaTRAF7基因相对表达量较高，取酥后，BgaTRAF1、BgaTRAF2和BgaTRAF3基因相对表达量在取酥后24 h内显著升高（PBgaTRAF2基因相对表达量在取酥后1 h即出现急剧升高，而BgaTRAF4、BgaTRAF5和BgaTRAF6基因相对表达量在取酥后降低。【结论】 中华大蟾蜍拥有一个完整的7成员TRAF基因家族，其成员在蛋白结构和系统进化上均表现出典型的亚家族特征。中华大蟾蜍TRAF基因家族成员在耳后腺取酥后表现出明显的时间依赖性规律，其中BgaTRAF1、BgaTRAF2、BgaTRAF3与BgaTRAF4、BgaTRAF5、BgaTRAF6基因分别作为协同单元被快速诱导或抑制，共同构成了中华大蟾蜍应对免疫创伤的核心转录调控网络。

来源：2025年第10期

《南方农业学报》期刊编辑部

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