南方农业学报

作者：樊梦薇, 张长萍, 冷亚东, 闫洁,

关键词：橡胶草, AP2/EREBP, 基因家族, 鉴定, 表达模式,

【目的】 鉴定橡胶草AP2/EREBP转录因子家族成员并进行表达分析，为深入探究其对天然橡胶的转录调控机制提供理论参考。【方法】 对橡胶草AP2/EREBP转录因子家族成员进行鉴定，并利用生物信息学方法对其进行亚家族分类、启动子顺式作用元件分析及蛋白保守基序、保守结构域分析，并用茉莉酸甲酯（MeJA）处理橡胶草根组织，获取该家族成员在不同处理时间下的表达差异数据，对表达差异显著（P<0.05）的3个基因进行组织表达特性分析。【结果】 共鉴定出228个AP2/EREBP家族成员，其中AP2亚家族成员31个、RAV亚家族成员1个、ERF亚家族成员92个、DREB亚家族成员91个、其他亚家族成员13个，基于各亚家族成员在基因组中OriID的大小分别将其命名为TkAP21~TkAP231、TkRAV1、TkERF1~TkERF92、TkDREB1~TkDREB91、TkAP2EREBP1~TkAP2EREBP13。亚细胞定位预测结果显示，228个家族成员中有129个成员只定位在细胞核，14个成员只定位在细胞质，其余成员在细胞核和细胞质中均有定位。228个家族成员均不具有跨膜结构和信号肽，其保守结构域、保守基序特点与进化关系基本吻合，具有大量的生长发育和胁迫应答相关的启动子顺式作用元件。选取3个MeJA处理后表达差异显著的家族成员进行表达分析，结果发现TkDREB62和TkERF84基因在叶中的相对表达量极显著（P<0.01、P<0.001）或显著（P<0.05）高于其他组织；TkERF91基因在根和叶中的相对表达量极显著高于花和花梗中的相对表达量（P<0.001）；TkERF91基因在叶、花梗和根中的相对表达量均极显著高于TkDREB62和TkERF84基因（P<0.001）。【结论】 橡胶草具有228个AP2/EREBP转录因子家族成员，其中DREB和ERF亚家族占据主导地位。基于结构域的亚家族分类结果和基于蛋白序列差异构建的系统发育树基本吻合，该家族成员在各亚家族内部表现出启动子顺式元件、蛋白质保守结构域以及保守基序上的相对一致性，但在不同亚家族之间存在差异；不同家族基因在组织表达和MeJA诱导后的表达水平上存在差异。

来源：2025年第9期

《南方农业学报》期刊编辑部

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