南方农业学报

作者：宋兴超, 王莎莎, 王云艳, 梅杰, 梁正其, 巴家文,

关键词：斑马鱼, 黑素皮质激素受体-1基因（<i>MC1R</i>）, 变异位点, 体色,

目的 克隆鉴定斑马鱼（Danio rerio）黑素皮质激素受体-1（Melanocortin-1 receptor，MC1R）基因编码区（Coding sequence，CDS），并进行生物信息学及序列变异分析，为开展MC1R基因生物学功能研究及揭示斑马鱼体色性状的调控机制提供基础资料。方法 以红色、黄色和蓝色斑马鱼群体共计219个样本的肌肉组织DNA为模板，通过PCR扩增、克隆测序和拼接获得斑马鱼MC1R基因CDS序列，随后进行生物信息学分析和基因序列变异分析。结果 获得MC1R基因全长1404 bp，CDS序列长972 bp，共编码323个氨基酸残基。MC1R蛋白含有7个跨膜结构域、4个胞外区和4个胞内区，呈典型的细胞表面受体样结构，主要定位于细胞质膜，存在4个潜在N-糖基化位点和26个磷酸化位点。斑马鱼MC1R基因与团头鲂和鱇浪白鱼的相似性较高，遗传距离最近，亲缘关系较密切。红色、黄色和蓝色斑马鱼群体共鉴定到2个变异位点，其中1个变异位点（g.334T&gt;C）位于CDS，存在TT和TC基因型，该变异未引起氨基酸的改变，另1个变异位点位于3'-非编码区（3'-UTR）（g.276A&gt;T），存在AA和AT基因型，且不同体色间2个变异位点g.334T&gt;C和g.276A&gt;T的基因型频率均一致。结论 MC1R基因序列在不同鱼类中既具保守性，又存在一定差异，蛋白结构在不同鱼类中可能相对保守且功能类似。MC1R基因可作为开展不同鱼类系统进化关系研究的分子标记，其在红色、黄色和蓝色斑马鱼群体中较保守，存在g.276A&gt;T和g.334T&gt;C变异位点，且2个变异位点可能存在连锁关系。

来源：2025年第7期

《南方农业学报》期刊编辑部

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