南方农业学报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:45-1381/S

国际刊号:2095-1191

南方农业学报杂志2025年第7期:EGCG对热应激下巴马香猪背最长肌中lncRNA表达的影响

发布日期:

作者:李银, 郑欣如, 韦洋洋, 韦崇万, 林鑫源, 李禛海, 蒋钦杨, 黄艳娜,

关键词:巴马香猪, EGCG, 热应激, lncRNA, 肌内脂肪,

目的 探究表没食子酸没食子儿茶素(Epigallocatechin-3-gallate, EGCG)对热应激条件下巴马香猪背最长肌组织中长链非编码RNA (Long non-coding RNA,lncRNA)表达的影响,为揭示热应激条件下EGCG调节巴马香猪肌内脂肪(IMF)沉积的分子机制提供理论依据。方法 选择20头8月龄雄性巴马香猪随机分为4组,对照组(TN)在22 ℃常温环境下饲养,3个高温处理组(HS0、HS250和HS500)均在35 ℃环境下饲养,HS0、HS250和HS500组日粮中分别添加0%、0.025%和0.05%的EGCG。试验结束后屠宰巴马香猪并采集背最长肌组织,提取总RNA并进行转录组测序。使用DESeq筛选差异表达lncRNA,并进行GO功能注释分析、KEGG信号通路富集分析与ceRNA互作网络构建。随机选取5个lncRNA靶基因,利用实时荧光定量PCR验证转录组测序结果的可靠性。结果 TN vs HS0、TN vs HS500和HS0 vs HS500组共筛选出263个差异表达lncRNA,共富集到2819个靶基因,其中lncRNA MSTRG.11234的靶基因PLPP1、ENSSSCT00000068789的靶基因PPARα和MSTRG.26033的靶基因SCD5与脂肪合成密切相关。KEGG信号通路富集分析结果显示,差异表达lncRNA靶基因富集到的信号通路中与脂质代谢相关的信号通路包括过氧化物酶体增殖物激活受体、腺苷酸活化蛋白激酶和磷脂酰肌醇3-激酶-Akt通路等。ceRNA互作网络构建结果显示,部分lncRNA可能通过ceRNA机制参与调控脂质代谢及应激反应。随机选择的5个差异表达lncRNA靶基因,表达趋势与转录组测序结果一致,表明转录组测序结果可靠。结论 筛选出263个差异表达lncRNA,其靶基因显著富集到过氧化物酶体增殖物激活受体、腺苷酸活化蛋白激酶和磷脂酰肌醇3-激酶-Akt通路等脂质代谢相关信号通路,其中PLPP1、PPARα和SCD5基因与IMF沉积密切相关。热应激可能通过调控lncRNA的表达,影响下游脂质代谢相关基因的转录活性,从而介导IMF沉积过程。

来源:2025年第7期

《南方农业学报》期刊编辑部

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