国内刊号:45-1381/S
国际刊号:2095-1191
发布日期:
作者:陶玺然, 李亚金, 邓金祥, 龙坤云, 孟玉芳, 张宏瑞,
关键词:横纹蓟马, 线粒体基因组, 基因重排, 系统发育,
目的 明确横纹蓟马(Aeolothrips fasciatus)的线粒体基因组结构特征,并依据线粒体基因组序列探究其系统发育关系,为进一步明确纹蓟马科各类群的亲缘关系和分类地位提供分子依据。方法 利用第二代测序技术(NGS)的Illumina NovaSeq 6000平台对横纹蓟马线粒体基因组进行测序,并对基因组序列进行注释和分析;基于50种缨翅目昆虫线粒体基因组中的13个蛋白质编码基因(PCGs)串联22个转运RNA(tRNA)基因共同构建数据集矩阵,以桃粉大尾蚜(Hyalopterus arundiniformis)作为外群,运用最大似然法(ML)和贝叶斯法(BI)构建系统发育树,分析横纹蓟马与其他种类蓟马之间的系统发育关系。结果 横纹蓟马线粒体基因组总长度为19167 bp,其中包括13个PCGs、22个tRNA基因和2个核糖体RNA(rRNA)基因,共计37个基因,并含有2个非编码的控制区(CR)。横纹蓟马线粒体基因组的编码区中有10处基因重叠区和21处基因间隔区。横纹蓟马线粒体基因组具有缨翅目昆虫典型线粒体基因的基因组成和排列顺序,AT含量为71.5%,表现为明显的AT偏斜。横纹蓟马线粒体的13个PCGs中,除cox3基因采用GTG作为起始密码子、nad3基因采用TTG作为起始密码子外,其余11个PCGs均以ATN作为起始密码子;对于终止密码子,除atp6和nad1基因采用不完整的T作为结尾、nad2基因以TAG作为终止密码子外,其他10个PCGs均采用TAA作为终止密码子。除trnH基因缺少TφC环、trnS1基因缺少DHC臂外,其余20个tRNA基因均呈现出完整的三叶草结构。横纹蓟马的基因重排发生剧烈,至少有26个基因发生易位。系统发育分析结果显示,横纹蓟马与印度纹蓟马(Aeolothrips indicus)聚在同一分支上。结论 成功获得横纹蓟马线粒体基因组完整序列,该虫的线粒体基因组结构与纹蓟马科昆虫线粒体基因组结构一致;系统发育分析表明横纹蓟马与印度纹蓟马的亲缘关系较近;纹蓟马科可形成一个稳定的单系。
来源:2025年第7期
《南方农业学报》期刊编辑部