南方农业学报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:45-1381/S

国际刊号:2095-1191

南方农业学报杂志2025年第6期:抗无乳链球菌罗非鱼及其杂交后代的鳃和尾鳍组织细菌16S rRNA测序分析

发布日期:

作者:刘奕, 吴昊天, 陈丽婷, 严欣, 肖俊, 陆颖,

关键词:罗非鱼, 无乳链球菌, 细菌群落, 抗病, 16S rRNA测序,

【目的】 探究抗无乳链球菌良种壮罗1号罗非鱼抗病机制与细菌群落的关系及其在杂交后代中的遗传效应,为通过杂交育种选育兼具快速生长和抗病性状的罗非鱼提供理论依据。【方法】 以吉富罗非鱼和壮罗1号罗非鱼为亲本进行自交和杂交,获得吉富自交F1代、壮罗1号自交F1代、吉富×壮罗1号杂交F1代、壮罗1号×吉富杂交F1代。采集4组罗非鱼的鳃和尾鳍组织,对16S rRNA的V3~V4区进行测序,分析不同样本细菌群落结构,采用基于线性判别分析的效应大小分析(LEfSe)筛选不同样本细菌群落间具有显著差异的生物标志物。【结果】 Alpha多样性分析结果表明,壮罗1号自交F1代鳃和尾鳍细菌群落的Shannon指数、Shannon even指数和Simpson指数均明显小于吉富自交F1代。壮罗1号×吉富杂交F1代和吉富×壮罗1号杂交F1代的细菌群落多样性也整体较吉富自交F1代明显下降。Beta多样性分析结果表明,壮罗1号×吉富杂交F1代、吉富×壮罗1号杂交F1代的鳃和尾鳍细菌群落组成较接近壮罗1号自交F1代,说明壮罗1号的细菌群落结构具有较好的遗传可继承性。壮罗1号自交F1代、壮罗1号×吉富杂交F1代、吉富×壮罗1号杂交F1代鳃和尾鳍细菌群落中,好氧或兼性厌氧菌栖水菌属(Enhydrobacter)的相对丰度明显高于吉富自交F1代。壮罗1号自交F1代鳃细菌群落中筛选到的生物标志物包含嗜酸菌2013Ark19i。【结论】 壮罗1号罗非鱼鳃细菌群落中存在相对丰度较高的需氧菌和嗜酸菌,表明鳃黏液形成了酸性环境,不利于无乳链球菌生长,而需氧菌能通过竞争性耗氧抑制无乳链球菌生长,推测壮罗1号罗非鱼的抗病机制与其细菌群落密切相关,且其细菌群落结构具有可遗传性,使杂交后代具有接近壮罗1号罗非鱼的抗病能力。

来源:2025年第6期

《南方农业学报》期刊编辑部

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