南方农业学报

作者：王元浩, 王培培, 肖珊, 张盛, 唐永凯, 黄彩林, 张志新, 郑海涛, 曹寿雄, 廖愚,

关键词：南方白甲鱼, 差异表达基因(DEGs), 性别差异, 代谢通路, SSR位点,

【目的】 通过转录组学分析揭示南方白甲鱼雌、雄性个体在基因表达及代谢通路上的差异，为其种质资源的开发利用提供参考依据。【方法】 基于Illumina HiseqTM 2000平台对南方白甲鱼雌、雄性成鱼的脑组织、肝脏和肌肉混合样本进行转录组测序，经质量控制及拼接组装获得的Unigenes通过Nr、COG/KOG、KEGG和SWISS-PROT数据库进行功能注释，然后以FDR≤0.05、|log2 Fold Change|≥1且P<0.05为标准筛选出差异表达基因（DEGs），利用GO功能注释和KEGG代谢通路富集分析DEGs的生物学功能及代谢通路，并通过MISA筛选SSR位点。【结果】 6个南方白甲鱼组织样本转录组测序共获得59628条Unigenes,N50长度为2209 bp，在Nr、COG/KOG、KEGG和SWISS-PROT数据库中的注释成功率为55.82%，以Nr数据库的Unigenes注释数量最多（33201条），且71.06%的注释基因与斑马鱼同源。雌、雄性南方白甲鱼转录组间共存在3116个DEGs，其中2254个呈下调表达、862个呈上调表达，上调表达排名前10的DEGs中有4个未被注释且仅在雄性南方白甲鱼样本中表达；DEGs主要注释到单生物过程、代谢过程、细胞过程、结合及催化活性等GO功能条目；KEGG代谢通路富集分析发现有614个DEGs富集在158条KEGG代谢通路上，涉及脂质代谢、氨基酸代谢、碳水化合物代谢、内分泌系统、运输与分解代谢等类别。从南方白甲鱼转录组共筛选出12012个SSR位点，其中以二核苷酸型SSR位点最多（6740个），占56.11%。【结论】 雌、雄性南方白甲鱼转录组中存在大量DEGs，导致雌、雄性个体在不同营养物质代谢的利用能力和策略上存在明显差异，且雌性南方白甲鱼的代谢能力可能更强。因此，后续开展南方白甲鱼生长性能、抗逆性等研究时应将性别代谢差异纳入变量因素。

来源：2025年第6期

《南方农业学报》期刊编辑部

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