南方农业学报

作者：王兵伟, 何静丹, 郑加兴, 韦绍丽, 周步进, 覃嘉明, 黄安霞, 时成俏,

关键词：玉米, 热带亚热带, 自交系, SNP分子标记, 遗传多样性,

【目的】对95个热带亚热带血缘玉米自交系的群体结构和遗传多样性进行分析，为热带亚热带血缘种质的创新和精准利用提供参考。【方法】利用10K玉米SNP育种芯片对95个玉米自交系进行全基因组分型扫描，所得数据进行质控后利用PowerMarker V3.25计算遗传多样性指标，利用MEGA X计算遗传距离并采用邻接法进行聚类分析，使用R包计算群体间遗传分化系数(Fst)并进行非度量多维尺度（NMDS）分析。【结果】从95个玉米自交系中检测到7812个高质量SNP分子标记位点，分布于玉米10条染色体上。95个自交系间的遗传距离变化范围为0.001～0.482，平均值为0.356。根据遗传距离信息将95个玉米自交系划分为A、B、C 3个类群，A群有5个自交系，B群有17个自交系，C群有73个自交系；C群又可分为5个亚群，每个亚群均有各自代表性的自交系材料，聚类分析结果与育种实践基本吻合。基于SNP分子标记位点进行统计，95个玉米自交系的平均杂合率为1.4%，基因多样性均值为0.3718，杂合度难测值均值为0.0139，最小等位基因频率均值为0.2886，多态信息含量均值为0.3004。A群的Fst（0.1491）最高，B群和C群的Fst（0.1422和0.1400）接近。NMDS分析也将95个自交系分成3个群，与聚类分析结果相对应。【结论】95个热带亚热带玉米种质具有较丰富的遗传多样性，被划分为3个类群，其中C群可划分为5个亚群，进一步明确了各自交系间的遗传亲缘关系。

来源：2025年第5期

《南方农业学报》期刊编辑部

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