南方农业学报

作者：丁兆建, 杜泽旭, 段霜, 梁栋樑, 欧阳晗, 李立姐, 林惠娇,

关键词：尖孢镰刀菌古巴专化型, 转录组测序, 差异表达基因, 甲硫氨酸合成, 致病性,

【目的】对尖孢镰刀菌古巴专化型野生型菌株及其胱硫醚γ-合酶基因（FoMETB）敲除突变体（ΔFoMETB）进行转录组测序，分析氨基酸合成通路中富集的差异表达基因（DEGs）的功能，为深入探究该病菌的致病机理和香蕉枯萎病的绿色防控提供理论依据。【方法】利用转录组测序技术对尖孢镰刀菌古巴专化型野生型菌株和ΔFoMETB菌株在PDB培养基中振荡培养18 h后的菌丝进行转录组测序，对筛选出的DEGs进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析，利用in silico技术分析氨基酸合成通路中富集的DEGs的功能，利用实时荧光定量PCR对转录组测序结果进行验证。【结果】野生型菌株和ΔFoMETB菌株的转录组测序共鉴定出10140个基因，其中在野生型菌株中特异表达的基因有923个、在ΔFoMETB菌株中特异表达的基因有706个、在野生型菌株和ΔFoMETB菌株均表达的基因有8511个；相较野生型菌株，ΔFoMETB菌株共有3077个DEGs，包括1598个上调和1479个下调的DEGs。GO功能注释分析结果显示，共有2465个DEGs注释在529个GO功能条目，显著富集的前4个GO功能条目为属于分子功能的辅酶结合和属于生物学过程的有机酸代谢过程、含氧酸代谢过程和羧酸代谢过程。KEGG信号通路富集分析结果显示，DEGs数量富集最多的前20个通路中有8个通路与氨基酸的合成与代谢相关。对氨基酸合成通路中的51个DEGs进行in silico分析发现，其中有22个DEGs已在不同种类真菌中被鉴定，其参与调控真菌的致病性、生长发育、氮源利用、氨基酸合成和次级代谢产物合成。利用实时荧光定量PCR检测10个DEGs的表达情况，其结果与转录组测序结果基本一致。【结论】FoMETB基因通过调控氨基酸合成通路中的关键DEGs来影响尖孢镰刀菌古巴专化型的生理特性和致病性。

来源：2025年第3期

《南方农业学报》期刊编辑部

查看南方农业学报杂志2025年第3期