国内刊号:45-1381/S
国际刊号:2095-1191
发布日期:
作者:王静, 兰金旭, 杨宁辉, 章瑶, 唐其,
关键词:钩吻, <i>GeSTR</i>, 克隆, 生物信息学分析, 表达分析,
【目的】克隆钩吻(Gelsemium elegans Benth)异胡豆苷合成酶基因(GeSTR),并分析其表达模式,为探究该基因在钩吻素己生物合成的调控机制提供理论参考。【方法】经液相色谱—质谱联用仪(LC-MS)测定钩吻不同组织中钩吻素己的相对含量,采用“基因组+表达谱+代谢组”的共表达关联分析方法,筛选得到合成钩吻素己的相关酶基因GeSTR,通过PCR克隆GeSTR基因的编码区序列(CDS),并结合生物信息学软件进行序列分析。利用实时荧光定量PCR检测GeSTR基因在不同组织中的表达模式。【结果】不同组织中钩吻素己相对含量排序:根>花>茎>叶,结合候选14个STR基因的表达谱信息,筛选得到与钩吻素己关联性最强的基因GeSTR。GeSTR基因的开放阅读框(ORF)大小为1026 bp,共编码341个氨基酸残基,相对分子量为38.31269 kD,理论等电点(pI)为5.69,脂溶系数和不稳定指数II分别为85.95和30.19,总平均亲/疏水性指数(GRAVY)为-0.158,推测GeSTR蛋白为稳定的亲水蛋白。GeSTR蛋白主要定位于细胞外基质和叶绿体2种亚细胞结构上,其N端含信号肽和跨膜结构域,可能为分泌型蛋白,具有32个潜在的磷酸化位点及1个N-糖基位点。GeSTR蛋白二级结构由无规则卷曲(41.64%)、延伸链(32.85%)、α-螺旋(15.54%)和β-折叠(9.97%)组成,不仅含有STR典型结构域,还含有YvrE结构域,与11个其他植物的STR氨基酸序列具有相似性,与金钩吻(Gelsemium sempervirens)的STR蛋白相似性最高(达93.84%),亲缘关系最近。实时荧光定量PCR结果显示,GeSTR基因仅在钩吻根和花中表达,且在花中的相对表达量极显著高于根部(PGeSTR基因在钩吻中的表达具有组织特异性。【结论】钩吻根和花中的钩吻素己相对含量高于茎和叶中,且GeSTR基因仅在根和花中表达,故推测GeSTR基因正向调控钩吻素己合成,具有催化耦合反应产生异胡豆苷的作用及其他潜在的多种功能,为后续研究钩吻素己及其他MIAs合成的途径及机制提供线索。
来源:2025年第3期
《南方农业学报》期刊编辑部