南方农业学报

作者：张艳, 沈卓, 杨易, 周轩, 吴增祥, 黎庭耀,

关键词：不结球白菜, KASP分子标记, 遗传多样性分析, DNA指纹图谱,

【目的】 基于全基因组重测序数据开发不结球白菜KASP分子标记，以期丰富该物种的遗传信息，为不结球白菜种质资源鉴定、基因定位及分子标记辅助育种提供技术支持。【方法】 对2份不结球白菜高代自交系C40和JY70进行全基因组及DNA重测序及比对分析，挑选出差异SNP位点用于KASP分子标记开发，并对55份不结球白菜种质资源进行遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建。【结果】 C40和JY70之间基因型不一致、测序深度大于10X且等位基因纯合的SNP位点有460849个。每条染色体上选择分布相对均匀的15个SNP位点设计成KASP引物，利用150对KASP引物对C40和JY70进行基因型分型检测，发现有86对引物成功分型，基于其对55份不结球白菜种质资源的基因型分型结果，筛选获得41个在不结球白菜中扩增质量高的KASP分子标记。41个KASP分子标记对55份不结球白菜种质资源的遗传多样性分析结果显示，其主要等位基因频率为0.5000～0.9273，平均为0.6643；基因多样性指数为0.1349～0.5000，平均为0.4257；多态性信息含量（PIC）为0.1258～0.3750，平均为0.3322,PIC>0.2500的位点占所有位点的94.5%，多态性较高。55份不结球白菜种质资源分为三大类群，相同类型的种质资源聚类在一起，其中地理来源相同的资源又聚类在一起，有效地反映了种质间的亲缘关系。利用PIC最高的15个KASP分子标记构建了55份不结球白菜种质资源的DNA指纹图谱。【结论】 开发获得41个不结球白菜KASP分子标记，可用于不结球白菜种质资源鉴定、基因定位及分子标记辅助育种。

来源：2025年第2期

《南方农业学报》期刊编辑部

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