国内刊号:45-1381/S
国际刊号:2095-1191
发布日期:
作者:朱华利, 陈玉霞, 钱程, 陈玉金, 于涵, 姜涛, 李璐璐, 鲁仪增,
关键词:文冠果, HD-Zip基因家族, 盐胁迫, 基因表达,
【目的】 对文冠果同源异型域—亮氨酸拉链(Homedomain-leucine zipper,HD-Zip)基因家族成员进行鉴定,并分析其在盐胁迫条件下的表达情况,为挖掘文冠果耐盐基因及培育文冠果耐盐新品种提供理论依据。【方法】 以文冠果全基因组数据为基础,鉴定获得HD-Zip基因家族成员,通过生物信息学工具对HD-Zip基因家族的理化性质、保守基序、基因结构、顺式作用元件、系统发育进化关系进行预测分析和双酶切法亚细胞定位。对2个月苗龄的文冠果幼苗进行盐胁迫处理(NaCl浓度为50、100、150 mmol/L),以NaCl浓度0 mmol/L为对照组(CK),并采用实时荧光定量PCR对文冠果盐胁迫下根和叶HD-Zip基因家族的组织表达模式进行分析。【结果】 从文冠果全基因组中共鉴定出29个HD-Zip基因家族成员,命名为XsHB1~XsHB29,除XsHB29外,XsHB1~XsHB28基因均定位到文冠果的12条染色体上。HD-Zip家族成员编码的氨基酸数量为202~838个,分子量为23567.07~92421.90 kD,理论等电点(pI)为4.75~8.98;亚细胞定位结果显示该家族蛋白均定位于细胞核中。系统进化发育分析将29个HD-Zip基因家族成员分为4个亚家族(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ),各亚家族成员基因和蛋白结构具有相似性。通过启动子顺式作用元件预测发现,HD-Zip基因家族启动子共有22种顺式作用元件,如非生物胁迫和植物激素响应元件。实时荧光定量PCR结果显示,50 mmol/LNaCl处理的叶片中,XsHB1、XsHB12、XsHB13和XsHB29基因的相对表达量均显著升高(P<0.05,下同);而XsHB5、XsHB12、XsHB13、XsHB24、XsHB29基因相对表达量在150 mmol/L NaCl处理后的根中均显著下调。亚细胞定位和瞬时转化结果显示,XsHB5是定位于细胞核上的蛋白,能负调控文冠果耐盐性。【结论】 从文冠果基因组中鉴定出29个XsHD-Zip基因家族成员,分为4个亚家族,各亚家族成员基因和蛋白结构具有相似性。其中,XsHB1、XsHB5、XsHB12、XsHB13、XsHB24和XsHB29等基因在文冠果盐胁迫响应中可能发挥重要作用,文冠果HD-Zip基因家族参与调控文冠果的生长发育、新陈代谢及其他应急反应过程。
来源:2025年第2期
《南方农业学报》期刊编辑部