南方农业学报

作者：邹成林, 黄开健, 黄爱花, 莫润秀, 翟瑞宁, 杨萌, 韦新兴,

关键词：玉米, 遗传多样性, 群体结构, SNP芯片,

【目的】 解析玉米自交系遗传多样性和群体遗传结构，为广西玉米育种实践提供理论参考。【方法】 以169份不同遗传背景的玉米自交系为材料，以7份广西骨干自交系和3份我国其他地方的骨干自交系为对照，用10K SNP玉米芯片对其进行全基因组扫描，通过遗传相似度、系统进化、主成分和血缘同源确认（IBD）等分析其遗传多样性及群体遗传结构。【结果】 筛选获得7565个高质量可用SNP分子标记，分布在10条染色体上，平均每条染色体上有756个，标记检出率均在97.12%以上，平均检出率达99.57%。174个玉米自交系的杂合率为0.21%～7.28%，平均为0.86%，有144个玉米自交系杂合率不高于1.00%，但有5个玉米自交系的杂合率偏高（31.29%～36.36%）。174份材料间的遗传相似度为0.486～0.999，平均为0.609，其中2个广西选育的西南骨干自交系B24(ZNC442)和CK_D2（桂A10341）与其他材料间的遗传相似度平均值分别为0.642和0.629。由系统发育进化树可知，包含10个参考自交系在内的179个玉米自交系划分为Reid群和热带亚热带群两大类，其中Reid群含13个自交系，占比为7.26%，热带亚热带群含166个自交系，占比为92.74%。热带亚热带群又可细分为7个亚群，其中以Suwan群和CM群为主，分别含56和51个自交系，占比分别为31.28%和28.49%。主成分分析结果显示，PCA1v3中玉米自交系聚类情况与系统发育进化树聚类结果基本一致，能明显区分Reid群和热带亚热带群，且热带亚热带群中大多自交系分布在CM群和Suwan群参考自交系附近。IBD分群结果显示，Reid群、Suwan群、CM群和A群的自交系数量分别有21、47、64和47个。系统进化分析、主成分分析和IBD分群韦恩图显示，三者共属Reid群、Suwan群、CM群和A群的自交系数量分别为12、35、18和11个。【结论】 广西玉米自交系来源复杂，遗传背景相似，不同分析方法的划分结果并不完全一致，需结合育种实践进行类群划分。广西选育的西南骨干玉米自交系ZNC442和桂A10341均属于A群，最理想组配模式为A群×Reid群，其次是A群×Suwan群和A群×CM群。

来源：2025年第1期

《南方农业学报》期刊编辑部

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