南方农业学报

作者：向进, 熊力, 李维, 谢婷婷, 杨齐心, 杨红文, 王春源, 吴燕, 张依裕,

关键词：柯乐猪, <i>XDH</i>基因, SNP位点, 繁殖性状, 产活仔数,

【目的】 明确黄嘌呤脱氢酶基因（XDH）单核苷酸多态性（SNP）位点与柯乐猪繁殖性状的关联性，为加速柯乐猪的育种进程提供理论依据。【方法】 选取87头健康经产柯乐母猪为研究对象，采用Sanger测序法筛查出XDH基因SNP位点，利用SPSS 22.0中的一般线性模型（GLM）分析SNP位点与柯乐猪繁殖性状指标（产活仔数、初生窝重、平均初生重、断奶仔猪数、断奶窝重及平均断奶重）的关联性，并通过RNAfold web server、ExPASy-ProtParam、NovoPro和SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析。【结果】 在柯乐猪XDH基因上共筛选获得12个SNPs位点，分别是第33内含子上的g.108047658C&gt;G和g.108047680C&gt;A位点，第34内含子上的g.108048009C&gt;T、g.108048044T&gt;C、g.108048046T&gt;C、g.108048047C&gt;T、g.108048054C&gt;T、g.108048153A&gt;T、g.108048208A&gt;G、g.108048212T&gt;C和g.108048242C&gt;T位点，第34外显子上的g.108047915G&gt;A位点。12个SNPs位点均存在3种基因型，属于中度多态位点（0.25 T、g.108048208A&gt;G、g.108048242C&gt;T、g.108048044T&gt;C、g.108048046T&gt;C和g.108048212T&gt;C位点的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡状态(PHWE&gt;0.05)，其余6个SNPs位点的基因型分布则显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(PHWE&lt;0.05)。除g.108047658C&gt;G位点与g.108047680C&gt;A位点、g.108048044T&gt;C位点与g.108048046T&gt;C位点、g.108048046T&gt;C位点与g.108048047C&gt;T位点间存在强连锁不平衡关系外，其余各SNP位点间均不存在强连锁不平衡关系。g.108047658C&gt;G和g.108047915G&gt;A位点对柯乐猪产活仔数的影响达显著水平（P&lt;0.05，下同），g.108047658C&gt;G位点表现为CG基因型个体的产活仔数显著高于GG基因型个体，g.108047915G&gt;A位点表现为AG基因型个体的产活仔数显著高于AA基因型个体。g.108047915G&gt;A位点突变导致柯乐猪XDH基因mRNA二级结构发生改变，最小自由能由-1508.90 kcal/mol上升到-1507.80 kcal/mol；且XDH基因等位基因G的突变还导致其编码蛋白分子式、相对分子量、理论等电点（pI）、不稳定系数及蛋白高级结构发生改变。【结论】 柯乐猪XDH基因第33内含子g.108047658C&gt;G位点和第34外显子g.108047915G&gt;A位点对其产活仔数的影响达显著水平，可作为柯乐猪繁殖性状改良的潜在分子辅助标记。

来源：2024年第6期

《南方农业学报》期刊编辑部

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