南方农业学报

作者：韩鹏夫, 彭文, 童桂香, 纪月鑫, 陈铭曲, 文水平, 韦信贤, 韦友传,

关键词：吉富罗非鱼, 干扰素调节因子9(IRF9), 无乳链球菌, Poly (I:C), 免疫应答,

【目的】 明确吉富罗非鱼（Oreochromis niloticus）干扰素调节因子9基因（OnIRF9）的结构特征和组织表达模式，以及无乳链球菌感染和Poly(I:C)刺激后的免疫应答情况，为揭示IRF9在罗非鱼免疫应答中的作用机制提供理论依据，进而丰富鱼类的IRF免疫学知识。【方法】 通过RACE扩增OnIRF9基因cDNA序列，通过ExPASy、SMART、SignalP-5.0、TMHMM-2.0和Euk-mPLoc2.0等在线软件进行生物信息学分析，并采用实时荧光定量PCR检测OnIRF9基因在健康吉富罗非鱼组织中的表达特征及无乳链球菌感染和Poly(I:C)刺激后的表达变化。【结果】 OnIRF9基因cDNA序列全长1828bp，包含50bp的5'端非编码区（5'-UTR）、485bp的3'端非编码区（3'-UTR）和1293bp的开放阅读框（ORF），共编码430个氨基酸残基。OnIRF9蛋白分子量为48.42 kD，理论等电点（pI）为6.23，含有IRF典型的DBD结构域和IAD结构域，不含信号肽和跨膜结构域。OnIRF9氨基酸序列与其他硬骨鱼类IRF9氨基酸序列的相似性为56.2%～95.7%，其中与美妊丽鱼IRF9氨基酸序列的相似性最高（95.7%）；基于IRF9氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树也显示，吉富罗非鱼与其他参考鱼类聚为一簇，尤其与美妊丽鱼的亲缘关系最近。OnIRF9基因在健康吉富罗非鱼脑、血液、肌肉、肝脏、皮肤、心脏、脾脏、头肾、肠道和鳃组织中均有表达，以脑组织中的相对表达量最高，显著高于其他组织（P<0.05），而鳃组织中的相对表达量最低。经无乳链球菌感染和Poly(I:C)刺激后，OnIRF9基因在吉富罗非脾脏、头肾和脑组织中的相对表达量在6 h内均极显著上升（P<0.01），但其相对表达量达到峰值的时间并不一致，提示OnIRF9基因在各组织中响应免疫应答时可能具有互补协调性。【结论】 OnIRF9具有IRF典型的结构域（DBD和IAD），尤其是DBD结构域的功能在脊椎动物中较保守；OnIRF9基因在中枢神经系统中发挥重要作用，且参与吉富罗非鱼抵御病原体入侵的免疫应答反应。

来源：2024年第6期

《南方农业学报》期刊编辑部

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