南方农业学报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:45-1381/S

国际刊号:2095-1191

南方农业学报杂志2024年第5期:香苏杂交猪KAT2B基因多态性与其生长性状的关联分析

发布日期:

作者:李吉凤, 阮涌, 蒋传美, 肖美美, 黄家锦, 许家利, 许厚强,

关键词:香苏杂交猪, <i>KAT2B</i>基因, 实时荧光定量PCR, SNPs, 生长性状,

【目的】了解香苏杂交猪组蛋白乙酰转移酶P300/CBP结合因子(KAT2B)基因在组织中的表达量,筛选其单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点,并分析基因多态性与生长性状的关联性,为香苏杂交猪新品系培育提供参考依据。【方法】以香苏杂交猪为研究对象,采用实时荧光定量PCR检测KAT2B基因在3日龄和6月龄不同组织中的相对表达量,通过直接测序检测KAT2B基因的SNP位点,统计SNP位点等位基因频率、基因型频率、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)及平均多肽信息含量(PIC)等,以卡方(χ2)检验分析基因型是否处于Hardy-Weinberg平衡状态,分析不同基因型与香苏杂交猪生长性状的关联性。【结果】实时荧光定量PCR结果显示,KAT2B基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和背最长肌6个组织中均有表达,与3日龄相比,6月龄KAT2B基因相对表达量在肝脏和脾脏组织中极显著升高(P&lt;0.01,下同),在肺脏中极显著降低。KAT2B基因Exon-2、Exon-14和Exon-15区域均分别存在1个外显子突变,分别为g.36682G&gt;A、g.104540G&gt;T和g.106651A&gt;G,3个SNPs位点PIC均处于中度多态性水平且Hardy-Weinberg平衡。g.36682G&gt;A位点优势基因型为GA型,等位基因频率G&gt;A;g.104540G&gt;T位点优势基因型为GG型,等位基因频率G&gt;T;g.106651A&gt;G位点优势基因型为AA型,等位基因频率A&gt;G。关联分析结果表明,g.36682G&gt;A位点各基因型生长性状之间无显著差异(P&gt;0.05),g.106651A&gt;G位点AA基因型与AG基因型胸深存在显著差异(P&lt;0.05)。【结论】香苏杂交猪KAT2B基因在各组织中均有表达且存在3个SNPs位点(g.36682G&gt;A、g.104540G&gt;T和g.106651A&gt;G),KAT2B基因可作为与香苏杂交猪生长性状相关的候选基因。

来源:2024年第5期

《南方农业学报》期刊编辑部

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