南方农业学报

作者：张永红, 杨大平, 许珍娣, 邵榆岚, 李玲利, 张宏瑞,

关键词：家蚕, 家蚕核型多角体病毒(BmNPV), <i>lef-8</i>基因, 遗传多样性, 系统进化分析,

【目的】了解云南省德宏州陇川县蚕区家蚕核型多角体病毒（BmNPV）株系的遗传地位和多样性，为厘清云南蚕区BmNPV的起源及科学防控家蚕血液型脓病提供参考依据。【方法】对分离自云南省德宏州陇川县蚕区的BmNPV进行lef-8基因克隆，通过ExPASy、SignalP 5.0、TMHMM 2.0、NetOGlyc 4.0、NetPhos 2.0及SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析，并基于lef-8基因核苷酸序列相似性，采用MEGA7.0中的邻接法（NJ）构建系统发育进化树。【结果】云南省德宏州陇川县蚕区BmNPV-YNLC株的lef-8基因序列全长2631 bp，共编码876个氨基酸残基；其编码蛋白（LEF-8）无信号肽序列，也不存在跨膜结构域，蛋白分子量为101.63 kD，理论等电点（pI）为8.8；在第750~800位氨基酸残基区域具有较高的疏水性，部分氨基酸位点表现为亲水性，且具有较高抗原指数和表面可及性；存在6个潜在的N-糖基化位点，62个磷酸化位点（25个丝氨酸磷酸化位点，23个苏氨酸酸化位点，14个酪氨酸磷酸化位点） ，但不存在O-糖基化位点。BmNPV-YNLC株与BmNPV-T3株的lef-8基因核苷酸序列相似性为99.7%，BmNPV-YNLC株lef-8基因在第96~98位核苷酸序列上存在3个碱基（CAA）缺失；此外，还存在2个非同义突变（646T→A和1895C→G）和7个同义突变。基于lef-8基因核苷酸序列相似性构建的系统发育进化树显示，BmNPV-YNLC株与日本和韩国地区的BmNPV亲缘关系较近，而与我国流行的BmNPV遗传关系较远。【结论】 lef-8基因在不同地区来源的BmNPV株系中高度保守，BmNPV-YNLC株与日本和韩国地区的BmNPV亲缘关系较近，但其LEF-8蛋白N端存在氨基酸缺失突变，说明BmNPVYNLC株为云南蚕区的新流行株系。

来源：2023年第7期

《南方农业学报》期刊编辑部

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